IMC Tips: IMCの面白い使い方

最新更新日:2013-05-07 (火) 17:31:04

  • PCRプライマーの管理に使う
    • 膨大な数のプライマーとテンプレートDNA塩基配列を上手に管理する?
  • PCRプライマー設計に使う
    • プライマー設計方法?
  • 複数テンプレートDNAに対して、一度にPCRを実行する
  • 遺伝子型判定に使う(遺伝子多型解析に使う)
    • 塩基配列の変異をもつフラグメント配列をゲノムにマッピング?し、そのシーケンス波形のマルチプルアラインメント?を見る
  • プラスミドベクターの管理に使う
  • 簡単な相同性検索用に使う
  • クローニングの学習用に使う
  • クローニングの確認用に使う
  • 多数のコンティグを1本のファイルにまとめる
  • 多数の塩基配列を1本の塩基配列にまとめる
  • アノテーションに使う
    • アノテーションウィンドウを使ってアノテーション作業を行う?
  • 比較ゲノム解析に使う
    • 複数のゲノムのフィーチャーや組成を1つの環状ゲノムマップ?に描く
    • Venn Diagram(ベン図)?を描画し、ユニーク遺伝子や共通遺伝子のリストをみる
    • ゲノム再配置マップ?を描画し、その細部構造をみる
  • タイリングアレイ解析に使う
  • DDBJ大量塩基配列登録に使う
  • 遺伝子文献管理に使う
    • その遺伝子に関連する文献ファイルを該当する遺伝子フィーチャー上にリンク設定し、遺伝子名や遺伝子機能による検索で文献を参照することが可能です。
  • 近縁種ゲノム塩基配列間の開始位置・方向揃えに使う
    • 複数の近縁種ゲノムを比較する場合に、それぞれのゲノムの方向がまちまちであったり、配列の開始位置が異なっている場合があります。このような場合に、ReverseComplement?機能や、Genome Cutting機能、およびLigation機能を使用して、それぞれのゲノムの方向と開始塩基位置を揃えることが可能です。
  • フィーチャー数を数えるのに使う
    • 注釈として登録されているフィーチャーキーの数を簡単にカウントし、表示することができます。
  • 一瞬で塩基配列とその注釈を逆相補鎖からみた形式に変換するのに使う
  • ラボノートとして使う

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Last-modified: 2013-05-07 (火) 17:31:04 (2263d)